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Je n'ecris pas ces immondes critiques de cinéma

Les experts disent que les tests PCR ne sont pas sujets aux faux positifs, malgré ce qui est sur Facebook

Les experts en maladies infectieuses résistent aux biologistes moléculaires « en fauteuil » qui continuent de faire de fausses déclarations sur les tests de réaction en chaîne par polymérase (PCR) – la principale méthode de diagnostic du COVID-19.

Ces allégations circulent sur les réseaux sociaux depuis le début de la pandémie et Ils ont été exposés maintes et maintes fois, mais elle continue de le faire dans une variété de forums.

L’une des fausses affirmations les plus courantes est que les tests PCR sont sujets à un grand nombre de faux positifs, et cela est souvent dû à une mauvaise compréhension du fonctionnement des tests, explique Jonathan Garry, biologiste à l’Université McGill. Bureau pour la science et la société à Montreal.

La biologie moléculaire est complexe, et Gary a déclaré qu’il est facile pour les gens de saisir un peu d’informations qui sont, en soi, correctes, mais de passer ensuite à des conclusions beaucoup plus larges qui sont inexactes.

« Nous y sommes tous sensibles », a-t-il déclaré.

« Je n’accuse pas les autres d’être stupides, stupides ou ignorants. Ce sont des préjugés avec lesquels nous devons tous faire face… Cela fait simplement partie de l’être humain. »

Les experts disent que les tests PCR sont systématiquement présentés comme le « gold standard » pour une raison. Le National Human Genome Research Institute aux États-Unis décrit la technologie comme « L’un des développements scientifiques les plus importants en biologie moléculaire ».

Les principaux avantages, en particulier pendant une pandémie, sont que les tests sont très précis et sensibles – et rapides.

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PCR vs cultures de laboratoire « old school »

La PCR, qui signifie « réaction en chaîne par polymérase », est une méthode de transcription répétée d’une partie du matériel génétique.

Il est utilisé pour amplifier rapidement de petites quantités de fragments d’ADN afin qu’ils puissent être étudiés plus en détail.

Les laboratoires modernes utilisent cette méthode pour tester toutes sortes d’agents pathogènes différents, y compris les virus, les bactéries, les champignons et les parasites.

Dans le passé, les scientifiques devaient cultiver des agents pathogènes vivants en laboratoire lorsqu’ils testaient des virus ou des parasites, mais les tests PCR ont remplacé certaines de ces méthodes basées sur la culture. (Fabrizio Bench/Reuters)

Dans le passé, les scientifiques devaient s’appuyer davantage sur des méthodes « fondées sur la culture », qui impliquent la croissance d’agents pathogènes vivants dans un environnement contrôlé, a déclaré Graham Tables, directeur médical et scientifique du Public Health Laboratory des Alberta Precision Laboratories.

Tables a déclaré que l’approche à l’ancienne est « à forte intensité de main-d’œuvre » – et lente.

« Cela prend un à deux jours pour le faire », a-t-il déclaré. « Et cela peut être indéterminé, ce qui signifie que vous n’êtes pas tout à fait sûr de cela. [particular] J’ai découvert un virus, car certains d’entre eux peuvent se ressembler. »

En revanche, les tests de réaction en chaîne par polymérase (PCR) recherchent un marqueur génétique unique à un agent pathogène spécifique, donnant aux scientifiques plus de certitude dans les résultats.

Dina Henshaw, médecin hygiéniste en chef de l’Alberta, qui a récemment consacré une conférence de presse à Combattez les « mythes » entourant les tests.

« Il n’interagit pas avec d’autres virus, même avec d’autres coronavirus », a-t-elle déclaré.

La Dre Dina Henshaw, médecin hygiéniste en chef de l’Alberta, fait le point sur la COVID-19 le 11 mai. Elle dit que les tests PCR permettent aux laboratoires de détecter le virus chez les personnes qui sont «au début de leur maladie» car elles sont très sensibles. (Chris Schwartz/Gouvernement de l’Alberta)

Un autre avantage des tests PCR est la rapidité avec laquelle ils peuvent être effectués.

« Vous pouvez configurer ce type de test pour un débit très élevé sur un système automatisé », a déclaré Tables, dont le laboratoire a effectué des millions de tests au cours de la dernière année.

Les tests PCR sont « extrêmement sensibles », a-t-il déclaré, ce qui signifie que « vous pouvez détecter de très petites quantités » de l’agent pathogène dans un échantillon donné.

Ceci est particulièrement utile avec COVID-19, a déclaré Hinshaw, car cela permet aux laboratoires de détecter le virus chez les personnes « au début de leur maladie » qui n’ont pas encore de quantités importantes de virus dans leur corps.

Cela signifie également que les tests PCR détecteront toujours de petites quantités de virus à la fin de la maladie d’une personne, lorsque son corps a principalement combattu le virus.

Même de petites quantités de virus morts peuvent être détectées – et ce fait, selon les experts, a été déformé par de fausses allégations concernant des défauts dans les tests.

Certaines personnes déforment délibérément le fonctionnement des tests PCR, explique Timothy Caulfield, responsable canadien de la recherche en droit et politique de la santé à l’Université de l’Alberta à Edmonton, ce qui « convient bien » avec une théorie du complot plus large sur la pandémie. (Craig Ryan/CBC)

Le problème est aggravé par le fait que certaines personnes déforment délibérément le fonctionnement des tests PCR, explique Timothy Caulfield, titulaire de la Chaire de recherche du Canada en droit et politique de la santé à l’Université de l’Alberta à Edmonton.

« Je pense que l’une des raisons pour lesquelles il n’est pas mort est que cela correspond si bien à la théorie du complot plus large selon laquelle toute la pandémie est un canular et que les dégâts ont été amplifiés », a-t-il déclaré.

« Ceci n’est bien sûr pas vrai. »

Limites du cours et du contexte

Un terme souvent entendu dans les cercles des médias sociaux où ces mythes persistent est le « seuil de cycle » (CT), qui fait référence au nombre de cycles de transcription nécessaires pour que le matériel génétique du virus soit détecté par un test de réaction en chaîne par polymérase (PCR).

« L’affirmation la plus courante que je vois est que les valeurs CT sont trop élevées, donc le test n’est pas fiable », a déclaré Caulfield.

Une valeur CT élevée correspond déjà à une petite quantité de virus, mais cela en dit plus sur l’échantillon que sur le patient. La qualité de l’échantillon peut varier en fonction de la méthode d’échantillonnage (p. ex., écouvillonnage nasal ou pharyngé), de la technique utilisée par l’agent de santé prélevant l’échantillon, de l’âge de l’échantillon et d’autres facteurs.

Paul Dieu et Kara Gill, avec l’équipe de diagnostics spécialisés d’Alberta Precision Laboratories, analysent les données de séquençage pour déterminer la lignée du virus SARS-CoV-2 dans cette image de fichier. (Laboratoires de précision de l’Alberta)

L’objectif principal d’un test PCR positif, dans le contexte de COVID-19, est de déterminer si le virus est présent, et non combien s’est produit dans un échantillon particulier.

« En fait, différents échantillons d’une même personne peuvent conduire à des valeurs différentes du scanner », Expliquer la santé publique en Ontario.

« Si un morceau d’ADN ne peut pas être copié, il n’y a pas de virus dans l’échantillon, ou il y en a une si petite quantité que ce test hautement sensible ne peut pas le détecter. »

Un test positif avec une valeur transversale élevée indique simplement la présence d’une petite quantité de virus dans un échantillon donné. Cela peut être dû au fait que la charge virale du patient est faible, ce qui peut signifier qu’il est au début ou à la fin de sa maladie. Ou il se peut que l’échantillon lui-même n’ait pas détecté beaucoup de virus.

« Tout test doit être utilisé dans le bon contexte clinique et épidémiologique », a déclaré Tables of Alberta Precision Laboratories.

« Mais vous ne pouvez pas ignorer le fait que vous avez un test positif et le signaler comme négatif. Cela n’a absolument aucun sens. »

L’approche « à l’ancienne » des tests est « exigeante en main-d’œuvre » et beaucoup plus lente que les tests PCR, explique Graham Tables, directeur médical et scientifique du laboratoire de santé publique de l’Alberta Precision Laboratories. Son laboratoire a effectué des millions de tests au cours de la dernière année. (AHSChannel / YouTube)

Les faux négatifs sont une préoccupation plus importante

Si quoi que ce soit, les experts étaient plus préoccupés par le risque de faux négatifs des tests PCR pour COVID-19, qui dépendent en grande partie du moment où l’écouvillon a été prélevé par rapport à la période d’infection.

Étudier l’année dernière Il a révélé que les tests ne détectent presque jamais le virus le premier jour de l’infection et ont tendance à être à leur meilleur au huitième jour, mais même alors, il peut y avoir des taux de faux négatifs allant jusqu’à 20 %. Après le huitième jour, l’étude a révélé que le taux de faux négatifs augmentait.

Les épidémiologistes en tiennent compte. C’est pourquoi vous avez entendu parler de cas « probables » de COVID-19, qui sont souvent classés comme tels lorsqu’une personne ayant une exposition connue présente des symptômes mais aucun test positif.

À l’inverse, les responsables de la santé publique envisagent également la possibilité que les tests de réaction en chaîne par polymérase (PCR) attrapent le virus mort chez un patient qui s’est rétabli et n’est plus contagieux.

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« C’est exactement pourquoi nous n’exigeons pas de test négatif avant de mettre fin à l’isolement », a déclaré Henshaw. « Et pourquoi nous nous concentrons sur les tests dès l’apparition des symptômes et après l’exposition plus tôt, afin de minimiser l’impact que cette excrétion prolongée peut avoir. »

Tout cela signifie que les maladies infectieuses sont complexes et que les tests PCR font partie du tableau plus large de COVID-19.

Les experts dans le domaine passent leur carrière à apprendre les subtilités de tout, alors Gary, de l’Université McGill, a déclaré qu’il peut être frustrant lorsque des scientifiques « fauteuils » ramassent une petite information et la transforment en conclusions erronées.

« Il doit y avoir un certain niveau d’humilité intellectuelle », a-t-il déclaré, « pour que ces idées soient traitées. »